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1.输精管梗阻：输精管、精囊先天性缺如;炎症性梗阻，如双侧附睾结核;手术损伤或输精管结扎等;以及前列腺炎、精囊炎均可引起精液质量明显下降。
2.精索静脉曲张：可导致睾丸血液淤积，有效血流量减少，生精的正常微环境遭到破坏，最终使精原细胞退化、萎缩，精子生成减少，活力减弱，畸形精子增多，严重者可无精子。输精管梗阻
内分泌异常
神经内分泌失调使垂体不能释放促性腺激素和分泌雄激素, 引起睾丸发育不全、精子生成障碍。垂体腺瘤可为内分泌性男性不育症的重要病因。男性内分泌调控
性交和射精功能障碍
射精功能障碍在临床上包括早泄、性交不射精和逆行射精。性交和射精功能障碍多为生理和心理原因所致的勃起不足和(或)性交频率不足, 或能正常进行性交, 但因糖尿病、膀胱尿道炎症、膀胱颈部肌肉异常、尿道下裂、手术或外伤损伤神经没有射精(不射精) 与逆行射精，精液不能正常射入阴道。
免疫学因素
血清中抗精子抗体( Antisperm antibody, AsAb)的存在导致男性不育, 当血睾屏障被破坏时(如生殖道创伤、炎症、手术等，睾丸或输精管的黏膜表面损伤等)，精子漏出或巨噬细胞进入生殖道吞噬消化精子, 精子抗原激活免疫系统产生抗精子抗体。当生殖道感染时, 可能由于抗微生物抗体与精子膜抗原有交叉反应, 造成AsAb的产生。也可能因男性精液中的免疫抑制因子缺乏而使精子受到免疫攻击。